LI-6800數據分析 | 文章的圖形和照片的拼接也可以用 R 啦

LI-6800高級光合-熒光測量系統

在文章中難免有太多需要拼圖的地方，例如作圖的時候直接將幾幅圖拼在一起，這種方式的拼圖比較好處理，有大量的軟件包做這個事情，例如優秀的 patchwork，還有一種就是實驗的拍照，需要拼圖，或者拍照和作圖拼在一起，這種方式我們通常都手動處理，實際上，現在在 R 里也有解決方案了，那就是今天要介紹的 figpatch 軟件包，與 patchwork 是絕配。

安裝

安裝很簡單，從 CRAN 即可，現在 github 不是那么好用：

要使用還是必須進行一如既往的操作：

使用

我這里使用兩次 RACiR 測量的數據，因為這兩個數據來源于水稻，所以我網上隨便找了兩個水稻的圖片，當做兩次測量的植株處理。

先將數據讀入：

后面簡化操作步驟，用 ggplot2 默認的 loess 方式擬合一下數據，不再進行一個非線性擬合后在寫入公式。

與作圖數據進行拼圖

實際上測量時水稻是種在溫室里相鄰的兩個水池內，長勢也一致，這里只是作為演示用，所以不要誤會。

拼圖時圖形我們可以設置長寬比，方便我們調整圖形的外觀，例如下面三個例子：

標簽

作為標準的科研圖形，加標簽很重要：

拼接照片

拼接照片也很方便：

拼接多個圖片

如果有大量的圖片，可以先把他們拼接成向量或列表，以及利用相關參數調整邊距等

添加特定文本

figpatch 實際上是對圖片進行 ggplot2 包裹，他的 fig() 實際上是 ggplot 對象，labels則是坐標軸 (x 或 y)。因而可以根據這個來定制特定文本的顯示。

參考資料鏈接